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新Algacount S300是迅数2014推出的藻类智能鉴定计数仪,专为大中型企业、科研和监测机构而设计。专家校验的藻类数据库进行了大幅扩容,并对淡水藻和海洋藻加以区分。新增两项“迅数”核心技术:生物相似性高精度智能搜索、混沌智能辅助分类识别,实现快速的藻类辅助鉴定和不同藻类的自动分割计数。
新版S300还具备:景深拓展和拼接;生物量分析;链状体、胶被群体内子细胞自动计数;单细胞微藻自动计数;色素体定位定量等多种藻类分析功能。
高配版的新S300更配置了MIC显微分析软件,满足科研用户的精细观察和分析需求。
精细、直观的藻类数据库、多模式查询
显微镜下的藻类复杂多样:同一藻类的观察图像会不同,如针杆藻,可以单细胞存在,也可以每个细胞的一端相连成放射状群体,从壳面看针形,而从带面看是长方形……不同门类的藻类鉴别要点*不同,甲藻观察的重点是纵沟、横沟、板片,硅藻观察的重点是壳面的花纹……
2014版S300藻类智能鉴定计数仪参考了《中国淡水藻类》、《中国海藻志》和水生生物学主流教材以及大量的藻类学文献,听取了藻类生物学家和藻类环境监测专家的建议,依据中国藻类系统分类学的主流学派,对原数据库藻种的类别和描述进行校验补充,增添了大量精美的图片。用户还可用多种方式进行藻种搜索和查询,如生物相似性高精度智能搜索、形态学搜索、分类学查询和常见藻查询等。
生物相似性高精度智能搜索
生物相似性高精度智能搜索是迅数新一代藻类智能鉴定的核心技术,通过“形态相似性”与“生物相似性”的有效结合,准确提取并融合藻种的生物特征,极大地提高了藻类搜索精度,使得快速藻类鉴定成为可能。
(1) 原理
l 颜色特征提取:依据颜色直方图提取藻细胞颜色特征。
l 纹理特征提取:基于Gabor滤波器的旋转不变性特征,提取藻细胞纹理特征。
l 智能搜索:将两种特征融合为特征向量,使用支持向量机的分类器进行训练,实现对藻细胞图像的分类
鉴别搜索。
(2) 实例:
混合藻辅助分类识别
混沌智能辅助分类计数是迅数在藻类识别研究方面的重大技术突破,利用藻细胞在颜色、尺寸、形状等方面的差别,初步实现了形态、色泽差异大的多类藻细胞辅助分类计数。
(1) 原理:
l 混沌遗传算法:利用混沌运动所具有的随机性、遍历性和初值敏感性,将
混沌状态引入到优化变量中,把混沌运动的遍历范围扩大 到优化变量的取值范围,从而实现对水体中所有藻类的图
像分割。
l 模糊C均值聚类算法:确定每个藻种样本数据隶属于某个聚类的程度,把
隶属程度相似的藻归为一个聚类。
(2) 实例:
单细胞微藻自动计数
为解决新能源、新食品原料微藻的研究和生产工艺控制,“迅数”开发了“卵形细胞辅助计数”和“复杂细胞辅助计数”两种图像分割算法,可以快速实现微藻细胞浓度测定。
多细胞分析(胶被群体、链状体)
针对用户渴望准确分析微囊藻、直链藻的子细胞数量,“迅数”研究了专门的算法,为类似的胶被群体和链状体藻类研究,提供了方便、快速的分析工具。
显微测量、生物量分析、色素体研究
为满足用户对藻类微观形态的研究,“迅数”提供了专门的显微分析工具。透明数字标尺可在不同物镜倍率下实现显微测量;生物量分析模块可根据显微测量数据、藻类几何模型,快速计算当前藻种的生物量;“色素特征快选”工具,可以依据藻色素特征,对色素体自动定量、定位。
仪器主要功能与技术指标
一、显微数字成像
Ø科研级彩色CCD相机,大视场显微图像动态观察、静态捕获
Ø手动、自动双模式控制拍摄
Ø多维景深融合:扩展高倍物镜景深,显现不同液层细胞
Ø超视野拼接:适合丝状、链状藻类的观察分析
二、藻类智能鉴定
1. 藻类专家数据库
Ø主数据库:藻类形态文字介绍、手绘图、彩色显微照片
Ø用户数据库:允许用户完善、补充藻类图库和文字。
2. 智能查询
Ø名称查询:根据中文名、拉丁名查询
Ø分类学查询:根据藻细胞所在门、属、种,进行查询
Ø关键词查询:根据藻细胞的文字描述中的特征词进行查询
Ø常见藻查询:可分别查询水华、赤潮、有毒藻、海洋藻、淡水藻
3. 生物相似性高精度智能搜索
Ø生物特征信息包含:藻细胞的颜色、形态、纹理特征
Ø智能搜索:将特征信息融合为藻细胞图像的特征向量,使用支持向量机的分类器进行训练,实现对藻细胞图像的分类鉴别搜索。
4. 形态学搜索
Ø一级形态:单细胞、多细胞群体、不分枝丝状体、分枝丝状体、膜状体、管状体、链状体、网状体
Ø二级形态:细胞形态、细胞结构、群体形态、母细胞壁、子细胞排列与数量、藻丝结构与分枝等
三、藻类计数与分析
1. 混合藻流程式计数
Ø浮游藻分类标记:采用不同颜色、不同大小的色圈标记各种微藻
Ø浮游藻分类计数:对各视野画面的藻类,按类点击、自动累积计数
Ø胶被群体分析:对胶被包围的多细胞群体,自动解析换算子细胞数
Ø链状体分析:对链状多细胞群体,自动解析换算,估算出链状细胞数
Ø藻类总数统计:对样本各种藻类的总数进行自动累计
Ø优势种自动排序、按门排序、优势群落组成百分比分析
Ø藻密度自动换算,自动计算生物量
2. 混合藻辅助分类识别
Ø混沌智能辅助分类计数:基于混沌原理,对混合藻实现模糊判断和分类计数
3. 单细胞微藻自动计数
Ø卵形细胞辅助计数:对轮廓清晰的单细胞微藻,动态调节、分割计数
Ø复杂细胞辅助计数:对背景清晰、形态复杂的单细胞微藻分割计数
4. 色素体分析、藻类测量、生物量分析
Ø色素体定量:依据藻色素特征,对色素体自动定量、定位
Ø标尺测量:具有透明、不透明2种标尺,可用鼠标拖动标尺,对藻细胞快速测量
Ø任意测量:鼠标点击划线测量藻细胞
Ø生物量分析:依据藻类形态数学模型,测量、计算生物量
5. 图像处理(高配版)
Ø自适应增强:分辨增强处理,突显藻细胞显微特征
Ø图像调整:图像亮度、对比度、饱和度、RGB三色任意调节,灰度图、负相图的转换
Ø图像补偿:通过线性补偿,对数补偿,贝尔补偿等多种数学方法对图像的失真部分进行补偿,使图像更加清晰
Ø图像锐化:通过增强图像的高频分量,使藻类边缘变得更清晰
Ø图像平整:通过图像平整处理,使图像背景均匀
Ø图像滤波:高斯滤波、低通滤波、中值滤波等6种滤波方式有效提高图像清晰度
Ø边缘检测:两种检测方式、三种算子结合多种检测选项更精确地提取藻类轮廓
Ø形态学处理:腐蚀、膨胀、开启、闭合等非线性数学形态学处理
四、数据管理、报表打印
Ø标注:可在已拍摄的藻细胞图片上,进行任意的文字、尺寸标注
Ø数据库:自动保存每批显微照片、统计标识和统计数据
Ø报告编辑、打印:提供报告编写模板、文本输入、打印预览
Ø数据导出:藻类统计数据、图片导出到EXCEL
五、配置说明
1. S300标准配置
Ø科学级彩色CCD(2580×1944)
ØAlgacount藻类智能鉴定计数软件
Ø品牌商务液晶电脑
2. S300高配版
Ø 科学级彩色CCD(2580×1944)
ØAlgacount藻类智能鉴定计数软件、MIC显微图像分析软件
Ø品牌商务液晶电脑
3. 用户自配
Ø显微镜(建议选用奥林巴斯、尼康、莱卡、蔡司中型号)
Ø显微摄像接口(建议选用各品牌原装0.63倍缩小镜C-mount 摄影接口)