微滤机应放置于与待处理水面相平的位置，污水是自己流入微滤机的滚筒内部的。在排水水泵启动后，滚筒外部的水位会下降，水将会 从滚筒内部向外部流动。水中的污物被不锈钢筛网拦截。运行一段时间后，被不锈钢筛网拦截到的污物越来越多，对水流的阻力越来越大，但排水流量却因为水泵的稳定运行而未曾减少，于是滚筒外部的水位不断下降。当水位下降到水位控制器所在的位置时，水位控制器会将电信号传递给控制中心，控制中心将启动滚筒电机和加压水泵。滚筒开始缓慢转动，同时，高压水泵将高压水从喷嘴里泵出，高压水将粘附在 筛网上的污物冲洗掉，污物被置于滚桶内部的集污槽所收集，然后从排污管排出。完成固液分离的过程。当滚桶内部的污物被冲洗，伴随着滚桶的转动，滚桶内外的水位又保持持平，微滤机又进入下一个循环。
微滤式固液分离机可以采用平衡饲料管理减少养分排泄磷；采用合理的清粪工艺和固液分离处理，以减少废水磷排放，提高固体粪便磷收集率；采用堆肥处理减少粪肥体积，方便运输减小区域磷载荷；沼气处理可提供能量并减少、损失；施用粪便时保持合理的粪肥和化肥磷比例及施用萤，减少土壤磷养分累积、避免淋洗或径流过程中磷养分损失。这里就可以用到一款有越来环保设备有限公司生产的一款微滤式固液分离机。