脱硫系统是为沼气燃烧、沼气发电等定向设计的主要工艺。结合沼气的实际需要，对沼气进行了系统的脱硫和脱水。脱硫采用物理化学结合，脱水采用机械、汽水分离膜技术，整个脱硫脱水处理工艺高效简单，管理方便，运行成本低。
干法脱硫是一种简易、高效、相对低成本的脱硫方式，一般适合用于沼气量小，硫化氢浓度低的沼气脱硫。干法脱除沼气气体中硫化氢（H2S）的设备基本原理是以O2使H2S 氧化成硫或硫氧化物的一种方法，也可称为干式氧化法。干法设备的构成是，在一个容器内放入填料，填料层有活性炭、氧化铁等。气体以低流速从一端经过容器内填料层，硫化氢（H2S）氧化成硫或硫氧化物后，余留在填料层中，净化后气体从容器另一端排出。
通过脱硫后的净化沼气进入沼气增压风机增压输送，一方面克服管道、设备、管件的阻力损失，另一方面使输送至发电机组前的沼气压力满足机组的进气压力要求。考虑到沼气是一种易燃易爆的危性气体，本方案中选用的增压风机进行了特殊的内部处理，以满足防腐、防爆、防泄露的安全性要求，保证整个脱硫脱水系统的安全。增压后的沼气进入缓冲罐，实现气液固的有效分离，同时达到进行气体稳压处理，以满足对发电机组的平稳供气，保证发电机组的安全、高效运行。