zui近，收集的11种单细胞，代表三种不同的放线菌Aci群落（acI-A1, acI-A7, acI-B1），可让研究人员更多地了解它们在碳和养分循环中所起的作用。

在大多数淡水生态系统中，zui普遍的微生物是放线菌Aci家族成员。据估计，它们占世界各地淡水湖泊和河流浮游生物的高达50%，但是，研究人员还不知道这些微生物在生态系统中所发挥的确切作用，以及它们如何影响碳循环。包括来自美国能源联合基因组研究所（DOE JGI）研究人员在内的一个研究小组，利用单细胞基因组学，更多地了解这些微生物和它们的生活方式。

在此研究之前，几乎只有一种acl细菌的完整基因组被测定。这项研究，部分是由DOE JGI团体科学计划资助支持，在DOE JGI中，研究人员从这些样本中，产生了10个单扩增基因组（SAGs）的草案组件，代表三个aci群落。然后，将这10个SAGs与以前另外一项研究中的一个SAG相比较，以更好地了解，哪些特征在acl部落中是保守的？以及这3个aci组与另外一个有何不同？

虽然从淡水中提取的单细胞还没有完整的基因组草图，但是研究小组发现了几个保守特征的基因，例如*新陈代谢，在所有三个aci群落之间是共有的。此外，许多SAGs含有一种酶，可使aci细菌获得蓝藻细菌合成的一种化合物，可储存碳和氮。研究小组也做了初步的尝试，试图弄清是否每种aci细菌群落都具有特殊生态位相关的基因，但是，由于没有完整的基因组，所以我们很难做出任何结论。

研究小组得出结论：“aci家族成员与其亲本（放线菌）及其他已测序的淡水细菌，是明显特异相关的。它们高度精简的基因组和小的细胞尺寸表明，它们与超微细菌共有广泛的生态位维度，例如SAR11分化枝的淡水成员。虽然这里分析的SAGs很多特性，只与以前发表的其他aci基因组一致，但是调查三种不同的群落表明，它们之间存在生态分化。”