逆转录-聚合酶链反应 (RT-PCR) 实验方法原理
时间:2024-05-06 阅读:144
逆转录-聚合酶链反应 (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR) 的原理是:提取组织或细胞中的总 RNA,以其中的 mRNA 作为模板,采用 Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成 cDNA。再以 cDNA 为模板进行 PCR 扩增,而获得目的基因或检测基因表达。
实验步骤:
一、总 RNA 的提取
按照总 RNA 提取实验步骤提取组织或细胞中的总 RNA。
二、cDNA 第一链的合成
目前试剂公司有多种 cDNA 第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以 GIBICOL 公司提供的 SuperScriptTM Preamplification System for First Strand cDNA Synthesis 试剂盒为例。
在 0.5 ml 微量离心管中,加入总 RNA 1~5 μg,补充适量的 DEPC H2O 使总体积达 11 μl。在管中加 10 μM Oligo(dT)12~18 1 μl,轻轻混匀、离心;
70℃ 加热 10 min,立即将微量离心管插入冰浴中至少 1 min;
取 0.5 ml PCR 管,依次加入下列试剂:第一链 cDNA 2 μl;上游引物(10 pM)2 μl;下游引物(10 pM)2 μl;dNTP(2 mM) 4 μl;10×PCR buffer 5 μl;Taq 酶(2 u/μl)1 μl。轻轻混匀,离心。42℃ 孵育 2~5 min;
加入 SuperscriptⅡ1 μl ,在 42℃ 水浴中孵育 50 min;
于 70℃ 加热 15 min 以终止反应;
将管插入冰中,加入 RNase H 1 μl,37 ℃ 孵育 20 min,降解残留的 RNA。-20 ℃ 保存备用。
三、PCR
取 0.5 ml PCR 管,依次加入下列试剂:第一链 cDNA 2 μl;上游引物(10 pM)2 μl;下游引物(10 pM)2 μl;dNTP(2 mM) 4 μl;10×PCR buffer 5 μl;Taq 酶(2 u/μl)1 μl;
加入适量的 ddH2O,使总体积达 50 μl。轻轻混匀,离心;
设定 PCR 程序。在适当的温度参数下扩增 28~32 个循环。为了保证实验结果的可靠与准确,可在 PCR 扩增目的基因时,加入一对内参(如 G3PD)的特异性引物,同时扩增内参 DNA,作为对照;
电泳鉴定:行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察结果;
密度扫描、结果分析:采用凝胶图像分析系统,对电泳条带进行密度扫描。