利用果汁灌装机将成份及灭菌后的成品果汁饮料灌装至空瓶内，封盖。具备空瓶消毒、洗瓶、灌装、封口等功能。充填阀门的充填方式取决于材料的性质。若有气汁、粒状果肉汁、高温灌装、高温灌装果汁，则灌装阀门和灌装方法都不相同。水果饮料灌装机分为塑料瓶装饮料灌装机、罐式果汁灌装机、玻璃瓶果汁饮料灌装机等。

在果汁饮料灌装生产线中，饮料灌装机集空瓶清洗、热充填、旋盖于一体。真空回流系统和热充填相结合，实现了自动化。溢出的果汁饮料都被吸进回流罐，再由饮料泵送回灌装前的UHT超高温灭菌器进行消毒、填充。上、下半圆封头全封闭液缸清洁，内部设有温度检测器，可任意设定温度85度。在生产过程中，一旦发生设备故障，果汁三合一灌装机将停用几分钟，果汁饮料的温度就会下降到85度以下。这时，灌装机将停止工作，液缸中的所有果汁饮料都要吸进回流灌装，要等再次灭菌后，才能继续灌装。它被称为果汁饮料热灌装。本机无自身加热功能，可控制物料的填充温度。果汁饮料不会滋生细菌，在85度环境下可以延长饮料的保存期。

果汁饮料灌装生产线配置处理工艺：浸水设备→带式水果采摘机→灌浆机→贮罐→过滤器→糖罐→双滤→双滤→除气→灭菌→保温罐→冲洗灌装盖→上盖机→纸箱包装。