水质自动监测系统是一套以在线自动分析仪器为核心，运用现代自动监测技术、自动控制技术、计算机应用技术以及相关的专用分析软件和通讯网络所组成的一个综合性的在线自动监测系统。它结合现代通讯技术，并利用现有通讯网络，实时的将仪器的测量结果，系统运行状况，各台仪器的运行状况，系统日志，系统故障，仪器故障等信息自动传送到中心站，并可接受中心站所发来的各种指令，实时的对整个系统进行远程设置，远程清洗，远程紧急监测等控制。
监控中心管理软件是水质自动监测系统的上层管理软件，它利用现有的通讯技术和计算机网络技术，实现准确、实时、快速的与远程基站进行通讯，是整个系统实现管理、控制、分析、远程维护等的指挥中心。其主要保证系统的正常运行和将监测的数据进行分析处理，为环境管理服务。
监测基站的在线自动运行是以现场PLC为控制中枢，以装有公司开发的基站管理系统软件的工业控制计算机为管理核心，配以所需单元组成。青岛佳明水质自动监测基站由采水单元、配水单元（含预处理单元）、分析单元、通讯单元、控制及数据采集单元组成，系统具备采水、预处理、配水、分析、数据处理、数据存贮、数据远传、远程控制、视频监控、机房侵入报警、运行状态远程报警等多项功能，实现在线连续或断续两种方式运行。能够满足流量、水温、P H、溶解氧、电导率、浊度、氨氮、挥发酚、、重金属、水质毒性等监测项目的具体要求。而且，系统具有很好的扩展性。可根据用户需要，很方便地增加其它标准分析设备，具有很强的扩展能力。

水质监测子站系统由以下几个单元部分构成：
系统控制设备及管理软件
水样采集单元
水样预处理单元
配水管路
反吹清洗与除藻单元
纯水制备单元
数据采集与传输单元
电力保证单元
防雷方案设计
安全与其他（质控间操作台、桌椅等）