猪圆环病毒检测方法
时间:2021-07-20 阅读:178
【产品名称】
通用名称:猪圆环病毒检测试剂盒(实时荧光PCR法)
英文名称:Porcine Circovirus Detection Kit (Real-Time PCR Method)
【包装规格】 25T/盒 & 50T/盒
【预期用途】
猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)在分类学上属圆环病毒科圆环病毒属,为已知的最小的动物病毒之一。本试剂盒利用实时荧光PCR原理,定性检测PCV,对PCV引起的猪的疫病的诊断和监控具有重要指导意义。
【检验原理】
本试剂盒针对PCV高度保守区域设计特异性引物和探针,在反应体系中含PCV基因组模板的情况下,PCR反应得以进行并释放荧光信号。利用仪器对PCR过程中相应通道的信号强度进行实时监测和输出,实现检测结果的定性分析。
【主要组成成份】
序号 | 组成 | 25T/盒 | 50T/盒 |
A盒 | 纯化柱 | 25个 | 50个 |
2ml 收集管 | 25个 | 50个 | |
裂解液(Buffer AL) | 10ml | 20 ml | |
洗涤液(Buffer RW) | 50ml | 100 ml | |
Nuclease Free Water | 5 ml | 10 ml | |
核酸提取说明书 | 1份 | 1份 | |
B盒 | PCV PCR反应液 | 437.5 μL×1管 | 875 μL×1管 |
PCV 混合酶液 | 62.5 μL×1管 | 125 μL×1管 | |
PCV 阳性对照 | 40 μL×1管 | 40 μL×1管 | |
PCV 阴性对照 | 40 μL×1管 | 40 μL×1管 | |
蛋白酶K | 600μL×1管 | 1.2ml×1管 | |
扩增试剂盒说明书 | 1份 | 1份 |
注:阴性对照为猪基因组DNA,阳性对照为PCV经灭活处理的核酸提取物。
【储存条件及有效期】避光-20℃以下保存,避免反复冻融,有效期12个月。
【适用仪器】ABI 系列、Bio-Rad系列、Agilent Stratagene MX系列、Roche LightCycler R480、Cepheid SmartCycler、Rotor-Gene系列、杭州博日系列等多通道实时荧光定量PCR仪。
【样本要求】
1. 新鲜采集的咽拭子、鼻拭子和粪便标本,并使用灭菌生理盐水悬浮。
2. 标本收集后若不能立即检测,可置于2~8℃冷藏过夜保存;如需长期保存,标本应冻存于-20℃~-80℃。
3. 标本保存期间应避免反复冻融。
【检验方法】
1. 试剂准备(试剂准备区)
(1)从冰箱中取出试剂盒, 从试剂盒中取出实验所需试剂,充分融化混匀并瞬时离心以去除管壁附着液体。
(2)核算当次实验所需要的反应数(n),并根据如下表所示反应体系计算当次实验所需要的各种试剂量。
n =阴性对照数(1T)+阳性对照数(1T)+误差预留量(1T)+样本数
单反液配制表(每份) | PCR反应液 | 17.5 μL |
混合酶液(Taq酶+UNG酶) | 2.5 μL |
(3)在无菌离心管中加入上述试剂,充分混匀后瞬时离心。按照20 μL/管分装量将试剂分装至PCR反应管。
(4)盖紧PCR反应管盖后将PCR反应管转移至样本处理区。剩余试剂放回-20℃以下冰箱冷冻保存。
2.样本准备(样本处理区)
用提供的病毒DNA/RNA核酸提取试剂盒(A盒)提取DNA,具体操作按照其试剂盒说明书操作。
3.加样
在上述制备好的PCR反应样本管中分别加入处理好的待测标本DNA各5μl、终体积25μl/管,盖好PCR反应盖混匀后瞬时低速离心,转移到PCR仪器上。阴性对照和阳性对照管则各加5μL试剂盒自带的阴性对照或阳性对照品,终体积为25μl/管,盖好PCR反应盖混匀后瞬时低速离心,转移到PCR仪器上。
4.PCR(PCR扩增区)
(1)取样本处理区准备好的PCR反应管,放置在实时荧光定量PCR仪样品槽相应位置,并记录放置顺序。
(2)按下表设置仪器核酸扩增相关参数进行PCR扩增。
反应体积 | 25 μL | 通道选择 | FAM通道采集PCV荧光信号 |
PCR 反应 条件 | 步骤 | 条件 | 循环数 |
UNG处理 | 50℃:2分钟(min) | 1 | |
预变性 | 95℃:3分钟(min) | 1 | |
预扩增 | 95℃:5秒(s) | 5 | |
55℃:40秒(s) | |||
PCR扩增 | 95℃:5秒(s) | 40 | |
55℃:40秒(s) (此阶段结束时采集荧光信号) |
注:ABI系列荧光PCR仪在设置时不选ROX校正,设置淬灭基团选择None。
【参考值(参考范围)】
1.试剂盒有效性判定:
(1)阳性对照:有典型S型扩增曲线或Ct值≤35。
(2)阴性对照:Ct值>38或无Ct值,线形为直线或轻微斜线,无指数增长期。
2.标本结果判定:
(1)阳性:标本检测结果Ct值≤35或有明显指数增长期。
(2)可疑:标本检测结果Ct值在35~38范围内。此时应对标本进行重复检测,如重复实验结果Ct值仍在35~38范围内,有明显指数增长期,则判定为阳性,否则为阴性。
(3)阴性:标本检测结果Ct值>38或无Ct值。
【检验结果的解释】
通道及检测结果 | 标本检测结果解释 |
FAM | |
阴性(-) | 标本中未检出PCV |
阳性(+) | 标本中检测出PCV |
【检验方法的局限性】
1. 当检测样本中被检核酸浓度含量低于本试剂盒的检出*可能会发生假阴性的结果。
2. 本试剂盒仅供标本初步筛查使用,对于本试剂盒检测阳性结果应进一步使用培养法进行确诊。
【产品性能指标】 产品的检出限为102CFU,产品CV值≤5%。
【注意事项】
1. 整个检测过程应严格按照本说明书要求分别在试剂准备区、样本处理区和PCR扩增区进行操作,各区实验服、仪器、耗材应独立使用,不能混用;实验用吸头采用带滤芯吸头;样本处理区应配有生物安全柜,样本处理在生物安全柜中进行操作;三个区应该配有紫外线杀菌装置。
2. 每次实验应该设置阴、阳性对照。
3. 为保证试剂不受标本污染,必须将混合酶液及PCR反应液保存于试剂准备区。
4. 试剂盒所有试剂在使用前应该在常温下充分融化混匀,并应瞬时离心。
5. 试剂盒内所配阴性和阳性对照在第一次使用前应全部转移至标本准备区,并单独存放。
6. 为防止荧光干扰,应避免裸手直接接触PCR反应管,并应避免在PCR反应管上进行任何标记。
7. 仪器扩增相关参数应按照本说明书相关要求进行设置;不同批号试剂不能混用。
8. ABI系列荧光定量PCR仪参数设置中不选ROX校正,淬灭基因选择None。
9. 实验过程中产品的废弃物应该进行无害化处理后方可丢弃。