蛋白质定量的方法
时间:2016-05-19 阅读:346
ELISA试剂盒生物学研究离不开定量。对于定量,通常需要利用已知浓度的分子绘制标准曲线。zui近,研究人员介绍了一种新方法,能利用串联质谱仪对多个蛋白质进行定量。
这种方法称为MARQUIS(Multiplex Absolute Regressed Quantification with Internal Standards),依靠两种现成的技术:重同位素标记的合成肽段以及质谱的同位素标记试剂。iTRAQ和TMT等试剂有着相同的分子量,但在质谱仪内产生特征的片段。
在MARQUIS方法中,对于每个待定量的肽段,研究人员建立重同位素标记的肽段。他们以不同的量混合这些肽段,并在组织或细胞裂解后立即将一种混合物加入每个生物样品中。研究小组的负责人认为:“这是关键的一步。你要尽早加入这些肽段,这样重同位素标记肽段和内源肽段的损失可同时发生。”
随后以同位素试剂标记样品,并加入质谱仪中。每个肽段产生两个峰:“重”峰代表合成的(加标)肽段,而“轻”峰代表内源性蛋白。通过定量前者碎片化所产生的标记离子,研究人员能产生每个肽段的标准曲线。之后他们能测定对应内源性肽段的信号,确定样品中存在多少分子。
研究小组利用MARQUIS定量了EGFR信号通路中的*磷酸化。在几种配体刺激之后,他们在多个时间点定量了EGFR网络内的磷酸化动力学,实现了EGFR磷酸化位点的定量比较,并证明了对于每种配体,受体磷酸化在性质上相似,但数量上不同。他们还培养了胶质母细胞瘤异种移植物,并应用这种方法定量了EGFR激酶抑制的效果。
有了这种方法,你就能看到那儿有多少靶点,药物是否命中靶点,以及更重要的是,靶点抑制是否有效阻断了下游的磷酸化。
据介绍,MARQUIS能同时定量10个样品中多达100种肽段。这只需要一台串联质谱仪(如三重四级杆)、市售的同位素标记试剂,以及重同位素标记的合成肽段。每个人都能实现。我们希望创建出一种相当简单的方法,而不需要什么诀窍。
Contactin 3 脑源性免疫球蛋白超家族蛋白3抗体
Carboxypeptidase B1 胰羧肽酶B1抗体
CRABP2 细胞维甲酸结合蛋白2抗体
C2orf80 2号染色体开放阅读框80抗体
phospho-CD32B(Tyr291) 磷酸化CD32B抗体
Complement C3 过敏毒素C3(补体C3)抗体
CD66c 癌胚抗原相关细胞粘附分子抗体
CPEB1 细胞质多聚腺苷酸结合蛋白1抗体
CST7 半*蛋白酶抑制剂7抗体
C22orf29 22号染色体开放阅读框29抗体
Contactin-1 神经细胞表面蛋白F3
Cathepsin C/DPP1 组织蛋白酶C抗体
Caspase 4 半胱胺酸蛋白酶蛋白-4抗体
caspase-3 p12 subunit 活化半胱胺酸蛋白酶蛋白3抗体
C7ORF61 7号染色体开放阅读框61抗体
Claudin 11 少突胶质细胞跨膜蛋白抗体