水泡性口炎病毒(VSV)核酸检测实验
时间:2023-11-13 阅读:417
水泡性口炎病毒(VSV)核酸检测实验
实验标本类型:发病动物唾液、水泡液、血清、病毒细胞培养液以及淋巴结等组织;
实验标本采集:
动物水泡液:无菌条件下水泡液500ul左右,置入1.5ml洁净EP管。
动物淋巴结等固体组织:无菌条件下取上述组织1g左右,置入1.5ml洁净EP管。
病毒细胞培养液:取500ul左右,置入1.5ml洁净EP管。
血清:用5ml注射器无菌条件下取外周血3-5ml,置入5ml洁净干燥管中。
实验标本的保存和运输:上述标本短期内可保存于-20℃,长期保存可置-70℃。但不能超过6个月,标本运送应采用0℃冰壶。
实验原理:选取一对水泡性口炎病毒(VSV)核蛋白基因保守序列特异性引物和一条特异性荧光探针,应用Trizol提取RNA,经逆转录酶作用将RNA转录成cDNA,后者在Taq酶作用下,配以FQ-Buffer(内含Mg2+、Tris-HCl等)、四种核苷酸单体(dNTPs)等成分,通过一步PCR-荧光探针体外扩增法对水泡性口炎病毒(VSV)RNA进行扩增,从而达到快速检测之目的。
实验目的:适用于检测动物(猪、马、驴、牛、羊等)唾液、水泡液、血清、淋巴结等病样组织标本以及细胞培养液中水泡性口炎病毒(VSV)RNA,适用于水泡性口炎病毒(VSV)感染的辅助诊断及流行病学调查,其检测结果仅供参考。
实验样品处理:
1:固体组织:取50mg左右组织用玻璃匀浆器匀浆或剪刀剪碎,加入500ul RNA提取液A(Trizol reagents),研磨或振荡至匀浆状,转移到1.5ml的EP管中,室温放置5min。
唾液、水泡液、血清样品或病毒液:取100ul液体标本加入500μl RNA提取液A(Trizol reagents)充分震荡,室温放置5min。
2:加入100ul氯仿,用力震荡15s,室温静置5min,4℃ 13,000rpm离心5min。
3:小心将上层水相转移到干净离心管中,加300ul无水乙醇,另加10ul RNA提取液B(内含不溶物,使用前室温溶解并充分混匀),充分混匀,13,000rpm离心1min。
4:弃上清,加入500ul 75%的DEPC乙醇,充分混匀,13,000rpm离心1min,小心吸去大部分乙醇。
5:将提取管敞口在室温空气中干燥5min待乙醇挥发干净,用20ul DEPC H2O溶解沉淀。
阴性质控品:取100ul阴性质控品加入500μl RNA提取液A(Trizol reagents)充分震荡,室温放置5min。后按2-5操作。
VSV-阳性质控品:直接取3μl进行PCR扩增。